Další rozšíření PBS Pro prostředí

CERIT-SC započal s přesunem běžných výpočetních strojů z prostředí PBS Torque @wagap do nového prostředí s plánovacím systémem PBS Professional @wagap-pro.

Stroje v PBS Pro jsou v PBSMonu označené nápisem "Pro" https://metavo.metacentrum.cz/pbsmon2/nodes/physical

Jak se stroje v prostředí @wagap budou uvolňovat, budou postupně přesunovány do PBS Torque (@wagap-pro).

Frontend zuphux.cerit-sc.cz zůstává prozatím (do převedení alespoň poloviny zdrojů) nastaven defaultně na prostředí @wagap. Pro aktivaci PBSPro je proto nutné, po přihlášení na frontend, provést aktivaci nového prostředí příkazem:

 $module add pbspro-client  ... nastaví PBSPro prostředí @wagap-pro

obdobně 

 $module rm pbspro-client   ... vrátí Torque prostředí @wagap

Důležité: V prostředí @arien již nezbyly žádné zdroje, během včerejška byly i zbývající standardní stroje převedeny do prostředí @arien-pro.

I když jsme zakázali přijímání nových úloh v prostředí @arien již minulý týden, ve frontách zůstalo přes 11 tisíc úloh, které přesunujeme (umožňuje-li to jejích zadání) do prostředí @wagap. Pokud však úlohy chtěly něco speciálního (GPU, lokalitu mimo Brno, požadují závislosti na dalších úlohách, apod.), budou muset být zadány znovu vlastníkem, už v prostředí @arien-pro.

Všechny frontendy, které původně obsluhovaly prostředí @arien, jsou nyní nastavené na prosředí @arien-pro.

Připomínáme hlavní odlišnosti PBS Pro:

Odlišná syntaxe (požadavek na 1 uzel ve frontě uv se 48 cpu, 20 GB RAM, 20 GB scratch, 1 hodina walltime):
- ```
qsub -q uv -l select=1:ncpus=48:mem=20gb:scratch_local=20gb -l walltime=1:00:00 skript.sh
```
Nutno vždy specifikovat
- walltime ve formátu [hh:mm:ss]
- velikost a typ scratche <scratch_local|scratch_ssd|scratch_shared>

Dokumentace k novému plánovacímu prostředí PBS Professional: https://wiki.metacentrum.cz/wiki/PBS_Professional

MetaCentrum & CERIT-SC

Ivana Křenková, Tue Mar 28 21:40:00 CEST 2017