Další rozšíření PBS Pro prostředí v CERIT-SC

CERIT-SC pokračuje s přesunem běžných výpočetních strojů z prostředí PBS Torque @wagap do nového prostředí s plánovacím systémem PBS Pro @wagap-pro.

Stroje zařazené v PBS Pro jsou v PBSMonu označené nápisem "Pro" https://metavo.metacentrum.cz/pbsmon2/nodes/physical

Volné stroje v prostředí Torque (@wagap) postupně přesunujeme do PBS Pro (@wagap-pro).

Frontend zuphux.cerit-sc.cz zůstává prozatím (do převedení alespoň poloviny zdrojů) nastaven defaultně na prostředí @wagap. Pro aktivaci PBSPro na tomto frontendu je proto nutné, provést po přihlášení aktivaci nového prostředí příkazem:

 zuphux$ module add pbspro-client  ... nastaví PBSPro prostředí @wagap-pro

obdobně 

 zuphux $ module rm pbspro-client   ... vrátí Torque prostředí @wagap

Přehled dostupných front: https://metavo.metacentrum.cz/cs/state/queues

Připomínáme hlavní odlišnosti PBS Pro:

Odlišná syntaxe (požadavek na 1 uzel ve frontě uv se 48 cpu, 20 GB RAM, 20 GB scratch, 1 hodina walltime):
- ```
qsub -q uv -l select=1:ncpus=48:mem=20gb:scratch_local=20gb -l walltime=1:00:00 skript.sh
```
Nutno vždy specifikovat
- walltime ve formátu [hh:mm:ss]
- velikost a typ scratche <scratch_local|scratch_ssd|scratch_shared>

Dokumentace k novému plánovacímu prostředí PBS Professional: https://wiki.metacentrum.cz/wiki/PBS_Professional

PBSPro Quick Start (PDF): https://metavo.metacentrum.cz/export/sites/meta/cs/seminars/seminar2017/tahak-pbs-pro-small.pdf

Představení PBS Pro ze Semináře gridového počítání 2017 (PDF): https://metavo.metacentrum.cz/cs/seminars/seminar2017/presentation-Klusacek.pptx

Uživatelská podpora centra CERIT-SC

Ivana Křenková, Thu Apr 20 21:40:00 CEST 2017