Seminar

Seminars concerning the Czech national grid environment MetaCentrum and the actual implementation of its services:

Planned seminar:

• autumn 2025 e-INFRA CZ conference and MetaCentre Grid Computing Seminar (Brno)
• 24.4.2025 Integration of FIJI in larger workflows, use in computational cluster" in the 4EU+ Biological Engineering - ImageJ Intensive course - MB100P10" -- introduction to computing in Metacenter and using FIJI with OpenOndemand
• 6.-12.4.2025 Školení na The 16^th Thematic CERN School of Computing (tCSC security 2025), Abingdon UK, téma Security of research computing infrastructures, detaily kurzu https://tf-csirt.org/transits/

Past seminars:

• 28.3.2025 UPCE Pradubice -- EOSC and Computing
• 27-28.3.2025 Czech PhD Bioinformatics Conference (ELIXIR) [PDF]
• 26.3.2025 Prezentation on Galaxy in PV269 Pokročilé metody bioinformatiky na FI MUNI
• 4.3.2025 Prezentation on Kontejnery v praxi, Praha -- e-INFRA CZ, kontejnery, AI a mrchožrouti [PDF]
• 4.3.2025 Prezentation MetaCentrum NGI For scientific computations, collaborative research & its support services (for EOSC), Brno  [PDF]
• 28.2, 7.3., 12.3. 2025  HandsOn prezentation at ČZU in  Prague [PDF1 intro], [PDF2 Hands on], [PDF3 OnDemand]

2024

• 9.10.2024 Presentation at Sitola Laboratory MUNI (PV273) - How to manage fairness in a distributed computing system [PDF]
• 14. 5. 2024 Představení nového výpočetního clusteru na CIV ZČU
• 9. 5. 2024 Laboratory of confocal and fluorescence microscopy, Biological Engineering - ImageJ Intensive course, Using the image processing package (FIJI) in MetaCentre
• 29.-30. 4 2024  e-IFNRA conference, Praha+ Computing Seminar 2024, Praha
• 21.-23. 3. XX Discussions in Structural Molecular Biology and 7th User Meeting of CIISB (Czech Infrastructure for Integrative Structural Biology), Nové Hrady, poster (PDF)

2023

• 30. 11. 2023 -- Hands-on, Institute of Biophysics of the CAS, https://github.com/CESNET/metacentrum-hands-on/blob/main/2023-11_IBP.md
• 30–31 May 2023 -- The Czech National Competence Center in HPC (IT4I) is inviting you to a course Introduction to MPI, which will be held hybrid (online and onsite) https://events.it4i.cz/event/165/.
• 26-27 April 2023 -- The Czech National Competence Center in HPC (IT4I) is inviting you to a course High Performance Data Analysis with R, which will be held hybrid (online and onsite) https://events.it4i.cz/event/163/
• 12. - 13. 4. 2023 - EOSC CZ + Grid Computing Seminar MetaCenter 2023
• 23. 3. 2023 MetaCentrum - grid service for scientific computations and collaborative research, within the internal seminar Machines & Methods IBP meeting, Institute of Biophysics of the CAS
• 8. 3. 2023 Hands-on Přf UK, Praha [PDF]
• February 7, 2023 Hands-on -- Biocev + JČU + Český zdravotnický ústav, Praha CESNET, [PDF]
• 12. 1. 2023 Seminar on services -The Silva Tarouca Research Institute (Praha)

2022 and older

•       12. 12. 2022 How to use accelerated computing resources in EGI for supporting Ukraine researchers,  webinar online PDF
• 10. 5. 2022 Grid Computing seminar 2022
• 18. 3. 2022 Webinar Introducing Kubernetes as another computing platform available to MetaCentrum users (in Czech language) REGISTRATION
• 2. 3. 2022 Presentation on seminar Bioinformatika (Marian Novotný, Katedra buněčné biologie, PřF UK) -- Metacentrum - Computation for the academic community [PDF]
• 6. 10. 2021  Presentation at Sitola Laboratory MUNI (PV273) - Running containers in Metacentrum, PyTorch and TensorFlow using GPU cards [PDF]
• 23. 9. 2021seminar to implement the EOSC (European Open Science Cloud) initiative in the Czech Republic
• 15. 9. 2021 Presentation at Sitola Laboratory seminar MUNI (PV273) [PDF] [VIDEO]
• july - Hands-on ČZU, Praha
• 23. 6. 2020 -  EOSC Landscaping webinar - European Open Science Cloud (EOSC) and recently completed EOSC Landscaping and its results in the Czech Republic.
• 20. - 24. 1. 2020 - CSIRT: Series of e-Infrastructure Security Meetings, Prague
• 18. 11. 2019 - Hands-on, AS CR (Vila Lanna, Praha) [PDF]
• 8. 11. 2019 - Hands-on seminář, UEB AS CR Olomouc (prof. Doležel group) [PDF]
• 16. 10. 2019 - Galaxy - Elixir, Code Week 2019, Farmaceutická fakulta UK v Hradci Králové a PřF Univerzita Hradeck Králové
• 3. 5. 2019 - Galaxy + Chipster, ČZU Praha
• 15. 4. 2019 - Hands-on, Sci Cuni (dr. Drbal group) [PDF]
• 30. 1. 2019 - Grid Computing Workshop 2019, Praha
• 29. 1. 2019 - Exkurze pro předmět PřF MU C2115 Praktický úvod do superpočítání, Brno [PDF]

• 23. 11. 2018 - Hands-on FI MU + research group from Gdaňs [PDF]

• 8. 6. 2018 - Presentation at 7. české uživatelské fórum Copernicus
• 11.5.2018 - Seminář gridového počítání 2018, Praha
• 16. 3. 2018 - Hands-on SCI MU, Brno [PDF]
• 2. 3. 2018 - Hands-on UPOL, Olomouc [PDF]
•  15. 2. 2018 - Hands-on II PřF UK, Prague [PDF]
• 1. 2. 2018 - Hands-on PřF UK, Praha [PDF]
• 30. 1. 2018 - excursion for SCI MU C2115 "Praktický úvod do superpočítání", Brno
• 25.-26. 2. 2018 - Workshop on CryoEM data analysis (CERIT-SC), Brno   
• 15. - 16.11.2017 - ELIXIR CZ Annual Conference 2017  https://www.elixir-czech.cz/events/elixir-cz-annual-conference-nov-2017

• 24. 4. 2017 - Hands-on seminar, SLU Opava [PDF]
• 30. 3. 2017 - Grid Computing Workshop 2017, Brno
• 23. 2. 2017 -  meeting with users of Luna, Exmag, Kalpa, Goliáš clusters (FZÚ AV ČR)
• 1. 2. - 27. 1. - excursion for SCI MU C2115 "Praktický úvod do superpočítání" 
• 31. 1. 2017 - Hands-on seminář Fakulta strojní, TUL [PDF]
• 2. 2. 2016 - presentation for students PřF MU [PDF]
• 1. 12. 2015 - Grid Computing Workshop 2015, Brno -- focus on bioinformatics
• 10. 11. 2015 - Tutorial "Introduction to Federated Cloud" and Dos and Don'ts for Virtual Applienace Preparation", Bari
• 12. 11 2015 - Security tutorial EGI Communitz Forum 2015, Bari
• 9. 6. 2015 - hands-on seminar, VŠE and ZČU [PDF]
• 18. 5. 2015 - Security tutorial EGI Conference 2015, Lisbon
• 25. 3. 2015 - OpenNebula Tech Day, Praha
• 27. 1. 2014 - exkurze pro předmět PřF MU C2115 Praktický úvod do superpočítání [PDF] https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2014/C2115
• 12. 12. 2014 - Galaxy Workshop, Brno [PDF]
• 2. 12. 2014 - Grid Computing Seminar 2014, Prague
• 20. 10. 2014 - 6. Methodical days (AV ČR), Congress Centre Jezerka, Seč, invited lecture
• 9. - 10.10. 2014 - MetaCentrum hands-on seminar, Zlín [PDF]
• 4. - 5. 10. 2014 - Linux days - HPC/GPU workshop, ČVUT FIT Praha, invited lecture [PDF]
• 2. - 3.10. 2014 - MetaCentrum hands-on seminar, Olomouc [PDF]
• 19. 9. 2014 - Ceremonial opening of new FI building and CERIT-SC server rooms, Fakulty of Informatics MU, Brno [PDF]
• 17. 9. 2014 - Konference projektu HyDaP (CzechGlobe), Pavilon Anthropos Brno, invited lecture [PDF]

• 5.-6.+14. 8. 2014 - Hands-on seminar, Czech Technical University in Prague and Charles University [PDF]
• 8. 7. 2014 - Hands-on seminar, Ústav histologie a embryologie LF MU [PDF]
• 25. - 27. 6. 2014 - invited lecture on ANSYS Conference 2014 a 22nd SVSFEM ANSYS Users’ Meeting, SVS  FEM [PDF]
• 23. 6. 2014 - Hands-on seminar,  UHK Hradec Králové [PDF]
• 20. 6. 2014 - Hands-on seminar,  UPCE Pardubice [PDF]
• 26. -28. 5. 2014 - Setkání zástupců ústavů a kateder mechaniky a kateder pružnosti a pevnosti 2014 z České a Slovenské republiky (http://aplmech.vsb.cz/sk2014/), prezentace k nasazení Ansys Remote Solve Manageru v prostředí národního Gridu [PDF]
• 6. 2. 2014 - Hands-on seminar, ZČU [PDF]
• 23. 1. 2014 - Hands-on seminar, CEITEC [PDF intro], [PDF hands-on]
• 21. 1. 2014 - možnost využití GALAXY pro IBA MU (Institut biostatistiky a analýz Lékařské a Přírodovědecké fakulty MU) [PDF]

• 25. 11. 2013 velký uživatelský Seminář gridového počítání 2013
• 13. 11. 2013 - seminář GridMathematicy, Ústav přístrojové techniky, Brno [PDF], příklad [AVI]
• 26. 9. 2013 - Hands-on seminář, CERIT-SC Brno pro projekty PASSEB a AdMaS [PDF]

• 13. 12. 2012 - Hands-on seminář, Institut biostatistiky a analýz, MU Brno [PDF]
• 7. 12. 2012 - Hands-on seminář, CEITEC MU Brno [PDF]
• 14. a 15. 11. 2012 - Hands-on semináře, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc [PDF]
• 11. 11. 2012 - PRACE workshop, IT4I Ostrava
• 7. a 15. 6. 2012 - Hands-on semináře, JU České Budějovice [PDF]
• 13. 4. 2012 - Seminář k Mathematice, FSI VUT, Brno [PPT]
• 7.6., 15. 6. 2012 - Hands-on seminar, JU České Budějovice [PDF]
• 13. 4. 2012 - Mathematica SW, FSI VUT, Brno [PPT]
• 11. 4. 2012 - Hands-on seminar, MU, Brno [PPT]
• 2. 4. 2012 - Hands-on seminar, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc
• 7. 11. 2011 - Grid Computing Seminar 2011, hotel International Brno
• 15. 10. 2010 Grid Computing Seminar 2010
• 12. 11. 2009 - Grid Computing Seminar 2009
• 26. 11. 2008 Grid Computing Seminar, the seminar concerning the Czech national grid environment MetaCentrum and the actual implementation of its services.